La primera temporada de Niko Kovač no empezó muy bien, camiseta barça ya que el Bayern se quedó atrás del Borussia Dortmund en la liga durante la primera mitad de equipacion barcelona la temporada. Cabe mencionar que durante la temporada 2009-10 no portó ninguna publicidad a excepción de un partido frente al F. C. Barcelona en el que mostró el lema «FUERZA CHILE» en apoyo a las personas que sufrieron el Terremoto de Chile de 2010 y en memoria de los fallecidos por dicho sismo.
