Dos meses después, el 1 de septiembre de 2013 fue fichado por € 5 millones por el Manchester City, volviendo a estar dirigido por Manuel Pellegrini (anteriormente lo dirigió en River Plate y en el Málaga Club de Fútbol). En julio de 2013 tras acabar contrato con el Málaga firmó por una temporada con el Atlético de Madrid. En su corta estancia en Madrid obtuvo si el subcampeonato de la Supercopa de España siendo su equipo derrotado por el Barcelona (estuvo en el banco).
