El fútbol base del CE Europa logró su mayor éxito la temporada 1995-96 cuando, después de dos ascensos consecutivos, logró situar a su equipo Juvenil A en la máxima categoría, la División de Honor. Fue una época dorada para el equipo charro: durante siete temporadas el equipo consiguió permanecer en la elite del fútbol español y en algunas de esas campañas rozando la competición europea.
